Проблема с ошибками в gnome-sound-recorder решилась вызовом gnome-audio-profiles-properties и прописыванием в профилях rate=48000. Я так понимаю, проблема, специфичная для креативовских карточек. Можно, наверное, как-то более изящно решить, но пока не нашёл в интернетах.