Проблема с ошибками в gnome-sound-recorder решилась вызовом gnome-audio-profiles-properties и прописыванием в профилях rate=48000. Я так понимаю, проблема, специфичная для креативовских карточек. Можно, наверное, как-то более изящно решить, но пока не нашёл в интернетах.

Gnome-sound-recorder выдаёт "Не удается записать звук с использованием профиля "Голос, без потерь". Проверьте его параметры. Возможно, отсутствуют нужные модули." При этом arecord в консоли всё слышит и пишет. В обоих случаях выбираю wav. Неясно, с чем шаманить.