Поставил MarvinSketch (это такое собственническое ПО для рисования молекул на Яве) и запустил его в oracle jvm (один хрен он был нужен чтобы в клиент-банк от Авангарда). Обнаружил что эта штука 1) тормозит 2) тормозит всеми восемью ядрами сразу. Удивился, поскольку раньше такого за marvin'ом замечено не было. Поставил icedtea - всё заработало. Мистика.