По данным следствия, Ходорковский, будучи руководителем нефтяной компании «ЮКОС», дал указание своим подчиненным Леониду Невзлину и Алексею Пичугину организовать убийство Петухова в 1998 году и покушение на управляющего компании «Ист Петролеум Хандельсгез» Евгения Рыбина в 1999 году. Мотивом покушений следствие считает корысть.