Блин, очень просто ведь. Jekyll никогда руками не использовал, и возможно не буду. Как на github.io добавить несколько строчек своего CSS (вот прямо руками, как будто я в 2000 г. через Netscape Navigator читаю про затонувшую подлодку «Курск») без всяких этих ваших тем?