Типичный веб-проект на php - это тыщи файлов, дохуища инклюдов при каждом запросе и прочие насилие над жестким диском. А что если document root сделать tmpfs и просто скопировать туда файлы проекта? Всякую статику, конечно, оставить на hdd, вынеся, например, на отдельный хост. По идее, даже на SSD даст прирост в скорости.