Как немного разгребусь с дипломом попробую настроить notmuch. Понравился мне его фронтенд в emacs, может или дополнить, или заменить gnus.

Пробовал git-annex - неудобств больше чем профита, да и зачем нужен git, если диффов изменений в файлах нет =/